課程資訊
課程名稱
碩士班書報討論III
Seminar III(M.S.) 
開課學期
108-1 
授課對象
醫學院  基因體暨蛋白體醫學研究所  
授課教師
陳沛隆 
課號
Genom7004 
課程識別碼
455 M0040 
班次
 
學分
1.0 
全/半年
半年 
必/選修
必修 
上課時間
星期四4(11:20~12:10) 
上課地點
 
備註
本課程中文授課,使用英文教科書。本所碩二必修。上課地點:基因體5樓505討論室。與陳信孚、陳佑宗、潘思樺、黃祥博、張以承、許書睿合授
總人數上限:10人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1081Genom7004_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

課程中將以書報討論方式,探討基因體與蛋白體醫學之應用與進展,以瞭解基因體與蛋白體醫學研究領域目前世界上發展趨勢,並討論國內目前之研究現況,使學生能了解各領域之發展,以期增加學生跨領域之整合能力。 

課程目標
課程中將以書報討論方式,探討基因體與蛋白體醫學之應用與進展,以瞭解基因體與蛋白體醫學研究領域目前世界上發展趨勢,並討論國內目前之研究現況,使學生能了解各領域之發展,以期增加學生跨領域之整合能力。 
課程要求
修課同學必須輪流報告論文,積極參與討論。
評量方式:平常參與討論與準備(50%);口頭報告(50%) 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
待補 
參考書目
各領域傑出期刊。 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
9/12  課程導論
簡裕峰
SALL3 expression balance underlies lineage biases in human induced pluripotent stem cell differentiation.

林郁鈞
Metabolic landscape of the tumor microenvironment at single cell resolution.

指導老師:張以承 
第2週
9/19  丁致中
Gut microbiota confers host resistance to obesity by metabolizing dietary polyunsaturated fatty acids

指導老師:陳佑宗 
第3週
9/26  黃馨儀
MULTI-seq sample multiplexing for single-cell RNA sequencing using lipid-tagged indices.

賴昱璁
Identification of drug-specific public TCR driving severe cutaneous adverse reactions

指導老師:陳沛隆 
第4週
10/03  陳國維
DNA methylation loss promotes immune evasion of tumours with high mutation and copy number load.

王子家
sgRNA Sequence Motifs Blocking Efficient CRISPR Cas9-Mediated Gene Editing.

指導老師:陳佑宗 
第6週
10/17  李東原
YAP, but Not RSPO-LGR4/5, Signaling in Biliary Epithelial Cells Promotes a Ductular Reaction in Response to Liver Injury.

丁之敏
Charting cellular identity during human in vitro β-cell differentiation

指導老師:黃祥博 
第11週
11/21  林郁鈞
Spatial heterogeneity of the T cell receptor repertoire reflects the mutational landscape in lung cancer.

簡裕峰
Functional cardiac fibroblasts derived from human pluripotent stem cells via second heart field progenitors.

指導老師:潘思樺 
第12週
11/28  黃馨儀
MYC paralog-dependent apoptotic priming orchestrates a spectrum of vulnerabilities in small cell lung cancer

丁致中
The Ngal reporter mouse detects the response of the kidney to injury in real time

指導老師:張以承 
第13週
12/05  陳國維
The genomic landscape of metastatic castration-resistant prostate cancers reveals multiple distinct genotypes with potential clinical impact.

賴昱璁 RNA sequencing identifies clonal structure of T-cell repertoires in patients with adult T-cell leukemialymphoma.

指導老師:許書睿 
第14週
12/12  李東原
Reference-based analysis of lung single-cell sequencing reveals a transitional profibrotic macrophage

丁之敏
Genome-wide microhomologies enable precise template-free editing of biologically relevant deletion mutations.

指導老師:陳沛隆 
第16週
12/26  王子家:
Search-and-replace genome editing without double-strand breaks or donor DNA.

指導老師:陳佑宗